台灣水韭是台灣特有種生物，原生棲地在陽明山夢幻湖，近年來因其他強勢水生植物入侵，面臨生存危機。2006年春天，學術界與保育團體展開搶救行動，移除強勢水草，清出台灣水韭生長空間，經過近半年的努力，目前夢幻湖生態保護區樣區已成功復育1萬棵以上的台灣水韭。長期研究台灣水韭的張永達表示，台灣水韭是台灣珍貴稀有生物，夢幻湖是台灣最小的生態保護區，保育標的物種就是台灣水韭，如果台灣水韭在夢幻湖消失，夢幻湖就失去生態保護區的意義，這次搶救台灣水韭成功，在生態保育上極具意義。

由中興工程顧問公司承辦的「雲林南部嚴重地層下陷區國土復育及利用」說明會，15日在雲林縣口湖鄉、水林鄉舉行，與會地方人士未將焦點放在計畫執行的土地重新規劃利用，反而更關心水患解決。縣長蘇治芬強調，將來縣府成立水利專責單位，用地解決，水患治理即可立即啟動。中興公司的初步計畫，畫定雲林縣水林、口湖及北港等3鄉鎮約80多平方公里土地作為示範點，土地產業調整規畫構想包括管理中心、遷居用地、聚落墊高、平地造林、觀光休憩、養殖專區等，同時排水整治及北港溪堤景觀、滯洪蓄洪設施等都一併在計畫內列入整體改善規畫。蘇治芬表示，這項計畫是8年800億治水計畫的配套計畫，治水預算已獲立法院通過，目前已進入細部規劃階段，但是治水所需用地仍待與雲林農田水利會協商，希望很快達成共識，即能立即啟動沿海地區的水患整治。

中科啟動，加上台塑大煉鋼廠、國光石化進駐，水利署估算中部地區供水需求超過31萬噸，而目前水源只夠9萬噸，供水缺口要等到大甲溪大安溪聯合配水系統完成，增加20萬噸供水，得到101年才能紓解。除了中科，水利署指出缺水高風險地區還包括桃園、新竹跟高雄。 水利署指出，全台有4個地區缺水機率大，供水是高風險。其中最頭疼的是台中地區，因為有中科、加上台塑大煉鋼廠跟國光石化，用水需求大增，而台中又是全台漏水率最高，抄現率最低最不賣錢的，估算中部地區供水需求超過31萬噸，而目前水源只夠9萬噸，除了在烏溪、大肚溪設攔河堰增加取水，供水缺口要等到大甲溪大安溪聯合配水系統完成，增加20萬噸供水，水利署長陳申賢說中部供水缺口得等到101年才能紓解。 另外供水高風險地區還包括桃園、新竹跟高雄，水利署表示桃園石門濁度問題要到97年底解決，新竹則因年底寶山二號水庫啟用，高雄年底爆管的南化聯通管修復完成，缺水問題可以解決

雲林縣虎尾鎮惠來里民眾成立「反對再生能發電廠委員會」抵制，他們指出，再生能發電廠發電產生的二氧化碳遠超過燃煤、燃油或燃氣，無助於二氧化碳減量，反而增加台灣地區二氧化碳的負擔。稻草燃燒後產生的廢氣，汙染空氣，遇雨下降則形成「酸雨」，汙染周邊農田，危害人體健康；將來電廠排出的冷卻水，更將嚴重影響農作物，因此，他們要求政府立即撤銷已核發的各種執照，停止興建並遷移到工業區。縣府14日表示，核准設立職權在中央政府，地方無由置喙。 再生能發電廠總經理黃家笙則強調，生質能源因為未增加二氧化碳淨排放量，因此被歸納在再生能源之內；而再生能發電廠生產的二氧化碳，在經過二次高溫爆炸後，已經所剩無幾，數量也遠低於於環保署規定的標準，況且電廠內也沒有煙囟黃家笙並指出，電廠沒有固態的廢棄物，冷卻水也是經過酵素分解後循環再利用，絕對不會排放廢水。黃家笙表示，由於一般民眾對生質能源發電很陌生，廠方將加強說明，與地方人士溝

為了解擁有150萬人口的高雄市，在高度開發下的生物多樣性概況，高市府建設局委託專家進行初步調查發現，在洲仔溼地記錄到植物至少231種、鳥類81種，而蓮池潭也有21種魚類和54種鳥類，2處為高雄市區內最佳的水鳥棲息地，並成功吸引水雉棲息。高雄市野鳥學會接受建設局委託，將高雄市生物多樣性調查結果編印成「繽紛生態in高雄」手冊，提供高雄市各國中、小學童認識港都生物多樣性風貌。市府近年積極推動溼地建設，較具規模的洲仔溼地、美術館溼地、本和里滯洪池溼地已建設完成，往北延伸的半屏湖溼地及援中港溼地，未來將南北串連成西高雄生態廊道。

日月潭水域生態近年來飽受外來的玻璃魚危害，導致奇力魚幾乎快消失殆盡；日月潭區漁會2006年以來並發現，原產中南美的紅魔鬼魚族群繁殖迅速，已成為數量僅次於玻璃魚的外來魚種，造成潭蝦數量大減。 自從民眾在日月潭放生玻璃魚，由於適應環境強，短短數年即成潭中族群最大的魚類，奇力魚也因此銳減。漁會在漁業署經費補助下，2005年開始以現金補貼向漁民收購捕獲的外來種魚類，其中玻璃魚佔70％，原產於中南美洲的紅魔鬼魚則約佔30％。漁會表示，日月潭的漁獲主要有奇力魚、潭蝦、曲腰魚、大頭鰱與烏鰡等，其中奇力魚與潭蝦是漁民的主要經濟來源。紅魔鬼魚大量繁殖後，已嚴重威脅潭蝦族群，但紅魔鬼魚的肉質頗佳，有食用價值，若漁業署明年仍補助經費，將可推廣食用紅魔鬼魚。

農委會主委蘇嘉全14日與彰化縣各級農會總幹事座談，就台灣農業人口老化現狀，再度推銷新農業運動「漂鳥計畫」。這項計畫規畫以「有機農業、休閒農業」等精緻農業課程為主，從學習到圓夢，農委會將動用所有資源提供協助，希望吸引有創意的青年返回農村，成為農業的生力軍，同時也為台灣農業注入新血輪，讓年輕人從了解農業開始，到最後能真的成為農業領域的留鳥。

經濟部水利署為配合行政院「挑戰2008國家重點發展計畫－水與綠建設」，在烏溪南岸彰化市段規畫的生態休憩園區，第一期工程花費3千萬元。完工後，卻被發現竹籬設施部分已被水沖毀、區內雜草叢生。採生態工程施作的第二期堤防景觀工程，當地居民質疑不夠牢固，要求改以混凝土施作，水利署第三河川局長許哲彥與居民協調時表示，第一期工程的缺失，將要求包商修復，至於堤防是否改為混凝土堤，則會向上級反映。

石門水庫河道放流口（PRO）自2月無預警湧沙封閉以來，大桃園地區單日近200萬噸原水都仰賴排洪隧道放水供應，加上2期稻作灌期已從7月1日起展開，2天1次排洪「高頻率」，創下國內水庫操作史獨有現象。 原為「農業水庫」的桃園石門水庫，以往藉由供給水力發電廠所需原水，將水源挹注至桃園大圳內；無奈石門電廠2004年遭受風災毀損，如今1、2號機面臨停擺狀態，重啟遙遙無期。肩負另一給水重任的河道放流口（PRO），2006年2月間也因無預警湧沙現象，淤沙迄今堆積深度超過水閘門；在無法正常開啟的情況下，石門水庫只能仰賴排洪隧道放水，2至3天排洪，大幅增加水庫操作困難。 北區水資源局副局長鍾朝恭說，儘管石門水庫被迫天天排洪，但攪動淤泥情形有限，加上單次時間僅有4小時左右，穩定供水應無太大困難。

北投纜車案陷入中央與北市府不同調的爭議中，日前北市府已接到內政部正式公文，並未如外傳要求全案必須重新送審，而是引用環保署最新解釋，要求業者如果要新增住宿及溫泉遊憩設施，必須依規定送請國家公園都市審議委員會重審，並通過環保署的環評；另內政部也撤銷5月19日通過廠商所提的環境差異分析。市府新工處長李四川認為，內政部並未要求北纜案必須全案重新送審，而是對新增設施部分要求必須依國家公園法規定重新送審，也就是新增設施要經環保署環評通過；如果不做新增設施，2001年既經環保署確認不必做環評，當然可以依法進行開發。李四川並透露，有關纜車的車廂及相關設備都已經送到台灣來了，廠商不做的可能性應該不大。

為遏阻科學園區開發作業基金負債繼續惡化，行政院要求國科會在財務問題未解決前，全面暫緩開發新科學園區。這項政策宣示是自1980年推動科學園區發展以來，行政院首度宣示全面暫緩開發新科學園區，近2年向國科會爭取爭取開發新科學園區的彰化縣、嘉義縣和花蓮縣等地方首長和立委，全部希望落空。 行政院的要求可能是因科學園區開發作業基金到2005年底負債已超過700億元，預估到2010年將爆增到1000億元，在財務狀況未改善之前，新設科學園區全面凍結。 竹科管理局長李界木則指出，行政院除了顧及南科高雄園區還有大片土地未利用外，主要考量竹科還有新竹生醫園區、宜蘭園區和銅鑼園區，南科也有高雄生醫園區等地尚未開發，希望這些園區在2010年完成開發後，再開發新科學園區。

經建會14日通過核四新增預算638億，投資總額調整為2335億元，商用運轉日期則再延後3年，到民國98年才正式商轉。新增預算中，有190億是因為機組擴大容量的費用，而因為停工直接造成合約上的損失則為72億，匯率調整而增加的費用是187億。台電董事長陳貴明特別解釋，台電和國外公司簽有採購合約，包括核反應器等四項機器類採購，以及顧問服務費，根據合約中的契約中止條款，政府必須多支付價金，目前談判的金額是72億左右。謝發達表示，至於核四延緩商轉時間，中間不足的電力將由桃園大潭電廠3至6號機組提前一年商轉補齊，合計容量為290萬（千瓦），約與核四機組容量相當。經建會指出，商轉日期再延長3年，主要是因為更換協力廠商、雜項設備製造及安裝多次流標、工程不符品管程序等因素。