澎湖地勢平坦，東北季風強勁再加上風向一致，是全球數一數二建立風力發電的絕佳地點，而風力發電正是21世紀最讓世人急欲開發的「綠色能源」。
澎湖科大在96年3月設立了風力太陽能發電實習所，從事教學研究，並且作為選修「綠色能源學程」的學生實作的場所，這堂「綠色能源學程」目前共吸引了180位學生選修。
此外，澎湖科大還與台電合作，規劃投資120億台幣設立「風車公園」，預計完工後年發電量可達到884百萬度電力，這麼多用不完怎麼辦？澎湖科大校長林輝政說，以目前技術，生產的電力無法儲存，因此還得等2013年海底電纜架設完成後，把其中的210百萬瓦電力輸回台灣本島。
林輝政指出，一座風力發電機約3000多萬，壽命是20年，運轉七年之後成本就能回收，往後的十三年，只要風一吹動，風力發電就是處於「賺錢」狀態。
反觀火力發電，在原物料持續上漲之下，火力發電頂多損益平衡，且發電時產生的二氧化碳等廢氣，有礙環保，因此風力發電必定是是未來電力的新趨勢。