農委會特有生物研究保育中心與台灣師範大學生命科學系合作，發現台灣畫眉與原產於中國的畫眉兩種間的基因歧異度高達3.5%以上，因此台灣畫眉是一個獨立種。他們已將此重大發現發表於即將出刊的世界知名鳥類學術期刊「IBIS」。 台灣畫眉將可正式認定為台灣第16種特有的鳥類，跟藍腹鷴、烏頭翁一樣，都是台灣特有種。
台灣畫眉主要在墾丁一帶可以看到牠們的蹤跡。不過鄭錫奇也說，台灣畫眉分布範圍海拔較低，遭人為開發破壞情形嚴重，導致野生族群大量減少。近年來更發現，有不少外來畫眉因飼主照顧不善而逃逸，在野外與台灣畫眉發生雜交，造成基因污染現象。特有生物中心呼籲國人不要任意引進外來種畫眉，更不要任意棄養，以免造成台灣畫眉遺傳污染的生態危機，使得特有的台灣畫眉生存遭受威脅。