儘管紅樹林被列為保育樹種，但新竹市的香山濕地，原本寬廣的潮間帶，因為紅樹林擴散，已嚴重影響濕地文蛤、螺貝類和候鳥的生態，為了維護濕地生態，市府在7月份委請荒野保護協會進行清除作業，經過分段清除，目前清除進度已達90%，未來清除的紅樹林，將運送到焚化爐銷毀。
荒野保護協會表示，香山濕地的紅樹林是最大的擴散源，若不及時適當清除，香山濕地將演變為大面積的紅樹林區，勢必改變濕地原有的特性生態環境，迫使現存生物的生存棲地受到影響，文蛤、螺貝類等底棲性生物，將因無法棲息而逐漸消失，候鳥覓食也將隨之縮減，生物多樣化也將快速下降。而這項清除紅樹林的工作，將在10月底全數完成。