強降雨造成濁水溪水質混濁，自來水公司正在雲林林內段進行伏流水開發工程。預期年底完工後，或許能取代集集攔河堰功能，讓濁水溪沿岸風飛沙揚塵減少。
為了因應極端氣候，自來水公司目前在濁水溪林內段進行伏流水工程，目前進度完成30％，預估年底前可以完工。自來水公司表示，林內伏流水工程總經費大約2億，將伏流水透過砂礫層自然過濾，水質佳可改善民生用水。預估完工後豐水期每日可供水3萬噸，枯水期每日1萬噸。
林內鄉長張維崢表示，未來伏流水工程完工後，水源能充足改善民生用水品質，並成為備用水源，就不用擔心枯水期缺水。若水源充足或許能取代集集攔河堰功能，讓濁水溪河床保持有水，來減少濁水溪風飛沙揚塵問題。