近些年，國家和地方政府投入大量專門經費進行環境治理，使得青藏高原「藍天碧水」風貌猶存，仍保持著較好的生態現狀。但青藏高原尚缺乏區域性的綜合環保規劃，一些相關部門之間也亟需建立統一協調的工作步調。
保護區面積居全國各省市區之首的西藏，目前已建立各級各類自然保護區38個，面積達40.83萬平方公里，占全自治區國土面積的34.03%。如此之多的自然保護區資金投入嚴重不足，國家和地方財政每年只能拿出幾百萬元的經費。其中，國家級的珠穆朗瑪峰自然保護區每年的保護經費不足30萬元人民幣，是所需經費的十分之一；其他已建的15個自治區級以上的自然保護區每年均只有一兩萬元的保護經費。由於資金有限，保護區很難開展相關基礎設施建設和科研、檢測等工作。