教育部擬對各國中小學實施「海洋教育」，特別借重澎湖海洋小學辦學經驗，邀澎湖縣參與擬定海洋教育課程綱要。
在教育部訂定「國民中小學海洋教育議題綱要」草案中，海洋教育主題包括了海洋休閒、海洋社會、海洋文化、海洋科學及海洋資源等，分別依學生年齡訂學習目標，如國小低年級的教學目標是讓小朋友喜歡親水，中年級應具備游泳基本技能並會欣賞海洋文學與藝術作品，高年級生至少能游完15公尺，並積極參與海洋環保活動，國中則至少能游完25公尺，並熟練海洋求生技能。
澎湖縣國中小學校長大都贊成海洋教育，但有老師說，正常課程都快教不完了，還要蒐集海洋課程資料，而且部分能力指標過於艱深，或是必須帶學生到海邊才能解說，面對升學及課業壓力，執行上可能面臨困難。另一方面，台灣大部分國中、小學沒有游泳池，設了游泳池更要有經費維修、消毒、換水，這些問題沒解決，就不能落實游泳課。