水庫最大功能就是調節供水，不過對石門水庫而言，相關單位供水網絡不健全，導致不能足量供水，不只單一縣市受影響，整個桃竹苗甚至雙北也受影響。
北水局透露，新竹市1天約需53萬噸原水，最近面臨供水吃緊問題，支援的水源包括石門水庫透過自來水網絡每天提供新竹10萬噸水及引頭前溪16萬噸、永和山再調6萬噸，加上當地寶山、寶二水庫22萬噸來緩和新竹缺水危機。 不過因供水網不健全，致水庫供應的10萬噸原水，不能全數送到新竹，中途被楊梅、幼獅等工業區和用水量高的工廠「攔截」，實際送到新竹的只有7萬噸。
北水局建議儘速健全桃竹苗、新北、台北供水支援系統，尤其加速翡翠水庫納入供水系統速度，讓石門水庫可釋出更多的原水幫忙新竹甚至苗栗，落實區域供水網觀念。