台北市政府每年汛期前都會進行河川疏濬工程，同時為解決淡水河航道淤積，工務局在淡水河及基隆河口處採用河拋工法，將阻礙航道的泥沙丟入較深的河道中，這種「河拋工法」已實行多年，但也引起當地漁民及學者質疑，此工法將破壞河川水文及生態。
人禾環境倫理發展基金會籌備處執行長，也是前關渡自然公園環境部主任方韻如憂心，河拋工法下的水文生態將被破壞，而前一次下拋的泥沙也會被水流帶回上游，市府等於「做白工」。
工務局副局長羅俊昇則表示，每年5月汛期來臨前，市府會視河道狀況進行疏濬；在淡水河及關渡地區為了航道順暢，加上擁有深水河床，所挖出的泥沙就丟入較深的河道中，這些泥沙可經由強力水流帶走，這是合法的工法。但他也表示，如此確實會增加河水濁度，對底棲生物環境也有所影響，然而目前也只有此種工法符合經濟效益。