據《中國海洋環境質量公報》顯示，2006年，中國全海域未達到清潔海域水質標準的面積約15萬平方公裡，較2005年增加約1萬平方公裡。近岸海域污染狀況仍未得到改善，其主要分佈在遼東灣、渤海灣、長江口、杭州灣、江蘇近岸、珠江口和部分大中城市近岸局部水域。
其中，無機氮、活性磷酸鹽和石油成為近岸海域主要污染物。渤海未達清潔水質標準面積佔全海域的26%～41%，仍高居四大海區之首。此次同時發布的《中國海洋災害公報》明確指出，2006年為中國海洋災害的重災年，共發生風暴潮、海浪、海冰、赤潮和海嘯等災害性海洋過程179次，與上年基本持平。公報顯示，2003年～2006年，中國沿海海平面變化呈起伏上升趨勢，上升速率仍高於全球平均值（為2.5毫米/年），並且加重了風暴潮、海岸侵蝕、鹹潮入侵等海洋災害，不同程度地影響了沿海地區社會經濟發展，威脅人民生命財產安全。