甘肅省氣候少雨，秦漢遺留長城較多，且秦長城土質經過嚴格篩選，城牆十分牢固；漢長城土層中加入蘆葦、芨芨草等植物，加固城牆。加上兩朝長城都建有水道、陶瓦，用於防水、導水，能有效抵禦自然侵蝕，自然因素的破壞微乎其微。
但經有關部門調查顯示，由於自然原因及人為破壞，甘肅省境內原有600多公里的秦朝始建長城、2,000多公里的漢朝始建長城，現已分別減少為不到200公里和600公里，不足初建時的1/3。大量秦漢長城在野外自生自滅，境內明代長城也在急劇萎縮。
文物專家表示，由於甘肅境內的長城大都分佈在毫無防護措施的野外，保護難度較大。當務之急是實行「退耕還牆」政策，將長城遺跡劃在特設區域內加強保護。否則，甘肅省僅剩的數百公里長城將逐漸消逝。據悉，甘肅省將於2007年啟動大規模的長城保護活動。