台北市政府執行生物多樣性指標調查計畫將近十年，發現大部分指標近年仍呈現穩定，僅濕地度冬鳥類指標顯著下降。台灣大學生態演化所教授李培芬舉小水鴨為例，指出小水鴨數量在2000年時仍有上萬隻，卻因棲地消失，導致剩不到1000隻。
李培芬表示，生物多樣性指標早期是由中央統計來做，後改由地方各自統計，其中以台北市建置最完整，生物多樣性指標調查計畫從2007年開始調查，逐一各物種的數量、分布範圍等，以此顯示台北市生物多樣性指標。
李培芬說，台北市各物種的變動趨勢相當穩定，部分指標甚至呈現增長，顯示台北市的物種數量和多樣性豐富，以青蛙為例，全台灣的蛙類約有33種，台北市就能看到其中20種。但濕地度冬鳥類部分，因土石流落帶來泥沙淤積，泥灘地因此「陸淤化」，使得小水鴨等度冬鳥類失去棲息地，全球數量均有下降趨勢，來台度冬數量近年更明顯驟降。