台灣的食鹽加碘政策，歷經全球公共衛生及經貿趨勢不斷調整，自1967年全面實施食鹽加碘政策，直到2004年加入世界貿易組織（WTO）後，開放不含碘的鹽進口迄今。
碘存在於土壤及海洋中的微量元素，台灣為海島國家，很多人以為不會有碘缺乏問題。日據時代，台灣帝國大學河石教授於1944年發表流行病學報告指出，地方性甲狀腺腫排行當時台灣10大常見疾病的第5名。當時國際預防缺碘的策略，主要是在食鹽中加碘。
台灣大學公共衛生研究所教授陳拱北在1958年，於新竹試辦食鹽加碘計畫，當年學童甲狀腺腫是51.3%，3年後，即降至4.1%。由於食鹽加碘試辦計畫成效不錯，政府1967年全面實施食鹽加碘政策，全國學童甲狀腺腫盛行率也從21.6%，4年後降至4.3%三，代表食鹽加碘對治療和預防甲狀腺變腫有很好效果。
不過，食鹽加碘政策也帶來其他問題。台大醫院基因醫學部及內科部主治醫師陳沛隆表示，碘吃太多會誘發有自體免疫疾病的人發病，如葛瑞夫茲氏病會有甲狀腺機能亢進等。
國內食鹽加碘政策直到2004年台鹽民營化，政府開放不含碘的玫瑰鹽及海鹽等進口鹽，台鹽僅部分含碘鹽才會特別標示，多數商品為不含碘鹽。去年1份市售鹽品碘含量監測暨健康風險評估研究指出，國內市售食鹽中多數不含碘。