環保署又發現有土壤和地下水、被重金屬汙染，其中彰化芳苑的農地雜草叢生，看起來荒廢很久，往下一挖，竟然埋了事業廢棄物，一檢測土壤重金屬鉛的含量，是管制標準的19.4倍！另外這處位於屏東長治的墓園，汙染更嚴重，裡面的汙泥汙染土壤，鉻的濃度，竟然高達管制標準的184倍。
環保署從98年開始，針對全國被非法棄置的場址，進行調查，最後在150處中，查出15處汙染場址，其中彰化有7處最多，其次是屏東3處，以及台南跟高雄各有2處，這15處本來只被丟了一般垃圾或是營建土方，但清查之後，發現將近一半被倒了有害事業廢棄物。
中華醫事科技大學護理系副教授黃煥彰表示，我們事業廢棄物的管理是嚴重失效，因為我們事業廢棄物沒有地方可以去，到處在流竄。
環保團體指出，許多被偷倒有害事業廢棄物的地點，都是廢棄的農田或漁塭，如果以後不知情，再拿來生產，汙染的危害會更大。