101年登革熱首例出現的時間提前，為及早因應疫情，環保署已於4月23日至6月27日針對全國22縣市辦理登革熱病媒蚊孳生源三級複式動員檢查評比，希望藉由逐級檢查方式，強化落實登革熱孳生源的清除成效。
環保署署長沈世宏表示，梅雨季即將到來，在雨季來臨前，請民眾動手檢查居家內外易孳生登革熱病媒蚊的容器及場所。
環保署與衛生署11日召開「101年第一次登革熱流行疫情處理協調會報」，針對防治策略進行討論，以避免101年再度發生登革熱疫情。環保署登革熱防治策略是以「清除孳生源為主，緊急噴藥為輔」原則，並結合村里志、義工與環保衛生機關的力量進行登革熱孳生源清除，持續辦理三級複式動員檢查。
環保署並呼籲民眾應以「清除再清除、檢查再檢查」及「巡、倒、清、刷」等防治工作觀念，並提醒民眾定期進行環境整理、清理髒亂點及清除登革熱病媒蚊孳生源，並加強個人保護措施以避免被蚊蟲叮咬。