哈爾濱藥集團製藥總廠位於哈爾濱城區西南部，它所釋放的臭味影響範圍波及周邊的高校，醫院和居民區，而且由於藥廠位於哈爾濱的上風口，有市民反映在離哈藥總廠很遠的地方都能聞到臭味。
產生臭味的主要原因是藥廠青黴素生產車間發酵過程中廢氣的高空排放，以及蛋白培養烘乾過程和汙水處理過程中，無全封閉的廢氣排放。2009年，對藥廠相鄰區域空氣品質檢測的結果，發現硫化氫氣體超標1150倍。氨氣超標20倍，均超過中國國家惡臭氣體排放標準。
而國家對發酵類製藥水污染物排放極限值有著明確規定，於是將水樣送到具有檢測資質的相關部門進行檢測，其檢測參考值表明：哈藥總廠排污口色度為892，高出中國國家規定極限值60近15倍。排污口氨氮為85.075，高出規定極限值35兩倍多，排污口COD為1180，高出規定極限值120近10倍。
在這個哈藥總廠製劑廠的廠區之外，有這個廠傾倒的各種各樣的生產藥品的廢料，這些藥物就在這個何家溝的旁邊。