日月潭俗稱船屋的四角吊網，自4月展開拆除行動以來，違規的149艘中，僅剩9艘尚未拆除，整個拆除率約9成4，船屋聯合稽查執行小組也再度喊話，迄6月30日以前，若違規業者能自行拆除，仍有機會獲得緩起訴自新的機會。
南投地檢署檢察長朱坤茂指出，2月底，曾有一名違規船屋業者被依竊占國土罪起訴，並求處7年有期徒刑，也是執行該項工作以來唯一的一起，據研判，此舉讓多數業者認為此次公權力是玩真的，主動配合拆除。
船屋亂象讓日月潭美景嚴重受影響，監委甚至對縣府及水利署提出糾正，南投地檢署、縣府、水利署、台電大觀發電廠、日月潭國家風景區管理處等單位，遂在去年10月起組成聯合稽查小組，也是首次司法與行政部門共同合作展現整頓船屋的決心。
未拆除的業者仍堅稱自己沒錯，有的還指控聯合稽查小組違反行政程序法，因依行政程序法規定，行政機關勘驗時應通知當事人到場，惟聯合稽查小組就船屋進行稽查時，有許多業者未接獲通知，也未曾召開過公聽會，善盡告知職責，顯然有違法令規範，惟稽查小組駁斥，並聲稱在執行拆除動作以前，便在違規船屋上張貼公告，雙方各執一詞。