澳洲醫政官員已做好面對該國東北部水患區出現疾病蔓延的準備，因為污濁的洪水夾帶污穢物、動物死屍和危險的瓦礫殘骸。
澳洲已有數十座城鎮被洪水淹沒，包括第3大城布利斯班（Brisbane）的廣大區域在內。澳洲發生水患的地區相當於美國德州（Texas）的兩倍大，或法、德兩國面積總和。
布利斯班有超過10萬棟住宅斷電，部分地區的清水供應也被迫中斷或限量提供澳洲醫學協會（AMA）警告：「我們預期，傳染病患者人數會上升，因為食物、飲水和環境衛生仍無法恢復正常。」「傳染病可能相當多樣化，從包括腸胃炎、寄生蟲寄生引發的嘔吐、腹瀉和腹痛在內的各種消化道疾病，到全身性傳染病都有。」
以蚊子為病媒的疾病預料也會增加，因為這種昆蟲會在污水中繁殖；任何傷口接觸到污穢液體，應接受消毒處理，並密切觀察後勢。
食物因大範圍停電而腐敗，構成另1個重大健康威脅。「這場災難事件將會對我們的衛生體系帶來好幾個月的衝擊，甚至可能好幾年。」