民進黨主席蔡英文28日訪視麥寮受害養殖戶時認為，目前最優先的工作，應該是指定專責單位，對農漁作物的損害儘快給予補償；並呼籲政府修正財劃法，讓工廠稅款能夠真正回饋地方，才能公平地照顧所有民眾。
針對民眾抨擊工廠在生產過程所帶來的外部效應，包括對環境的污染、公共設施的負荷和對安全的衝擊，全部留在地方，蔡英文指出，稅收都上繳中央，而無公平合理的回饋機制，是導致民怨不斷累積，造成長期對立與抗爭的主要原因，未來應透過財稅劃分制度進行調整。
針對六輕的善後問題，蔡英文呼籲，中央、地方、民眾與廠商四方應趕快坐下來協商，尤其，中央政府要展現積極解決問題的誠意與魄力，不要讓衝突情勢繼續持續升高。