台南縣的農作物，最近飽受病蟲害肆虐，農糧署推測，可能是八八水災過後，鳥類大量死亡，病蟲天敵減少，才會造成蟲害肆虐．農糧署緊急下令把會產生病蟲害的綠肥田菁耕鋤，希望能夠遏阻災害擴大。
在台南縣造成斜紋夜盜蟲肆虐的綠肥田菁，已經全數被耕鋤，但在後壁鄉，休耕土地上種植的其他綠肥，同樣也飽受病蟲害之苦，爬滿了各式各樣不同的病蟲，讓農民束手無策，成千上萬的害蟲，靠著綠肥壯大，肆虐著一處又一處的農作。
根據統計，台南縣市今年二期稻作休耕的面積就比去年多了2461公頃，居全台之冠，休耕土地多，也增加了害蟲肆虐的機會．農民老化，加上7月到10月颱風多，病蟲害也多，風險太高，讓農民寧願坐領休耕補助也不願種田。