八八水災漁損達到41億元，創下20年來新高，其中養殖漁業更是首當其衝。學者指出，運用室內的再循環水閉鎖系統養殖，不僅能避免大量耗水及環境污染，也能改善傳統養殖漁業靠天吃飯的窘境，提高產能。
國立海洋大學水產養殖系教授郭金泉則表示，台灣以往為了水產養殖，往往超抽地下水，造成地層下陷、海水倒灌、國土鹽化、侵蝕而喪失國土，除此之外，國人為了嘗鮮，紛紛引進外來種，造成生態威脅。
「一味以經濟掛帥而忽略永續經營原則的水產養殖，社會及環境所付出的代價，恐怕不是區區數億美元外匯所能彌補的。」郭金泉教授建議，台灣的養殖漁業應該參考世界潮流，例如使用再循環水閉鎖系統養殖、同一地點輪流養殖（如農業之輪耕）不同水產生物、增加育種投資等。
以「再循環水閉鎖系統養殖」為例，在室內使用水循環系統，不但可以避免因為風災、寒害所產生的漁損，且因為水循環利用，用水量是傳統流水式養殖的1/50到1/10，產量卻可達20倍以上。