陳水扁總統11日返鄉視察曾文溪流域堤防整治工程，支持整治經費比照基隆河整治模式以專案辦理。台南縣政府12日已著手準備相關防洪治水規劃，提案爭取水利署早日補助。
台南縣長蘇煥智說，曾文溪流域沿岸地區，每逢下大雨、水庫洩洪，水患問題就成為民眾的苦情，唯有政府以專案方式分年整治才有辦法解決。陳總統支持曾文溪流域整治經費近100億元比照基隆河整治模式，由水利署以專案計畫方式辦理，令縣府和當地民眾喜出望外。
縣府水利局長彭紹博說，曾文溪中游河段尚約有23.5公里堤防待建，整治經費約39.3億元；曾文溪流域安定、溪尾、番仔田、後營、渡頭及大內等六大區域排水系統，易受曾文溪水位上漲淹水，整治經費預估為37.5億元；流域的支流菜寮溪護岸設施、疏浚工程及用地補償經費約需22億元；加上堤防興建用地取得經費32億多元，總計曾文溪流域的整治經費達99億多元。至於柯羅莎造成行水區內農損，陳總統也要求水利署從寬、從簡補償農民損失。