台東縣沒有工業污染，但民國96年辦理農地土壤調查作業，意外發現35處，共計14.0737公頃農地土壤中含銅、鋅等重金屬，且超過法規標準，經多年來輔導農民休耕、禁用生雞糞與置換客土，已有32處農地解除管制，恢復農耕，改善率達9成以上。
台東縣環保局水質保護科科長李菊芬表示，台東農地土壤重金屬污染源包括農民使用農藥、化學肥料及生雞糞等，其中以生雞糞為大宗，由於雞場養雞的飼料中往往含有重金屬，雞隻吃下飼料，重金屬再隨糞排出雞體外，農民使用雞糞當肥料，因而污染土壤。
縣環保局指出，歷年來農民配合污染改善輔導，除了休耕，禁用生雞糞，同時使用客土置換土壤，至今年8月底前，完成畜牧業周邊農地及使用生雞糞農地監測後，有32處農地獲改善並解除列管，剩3處農地，面積共1.0930公頃列管中。