10年來原民會與內政部一直爭議不休的原住民土地主管機關課題，為讓事權統一，行政院長蘇貞昌裁示，主管機關由現行內政部轉移到行政院原住民族委員會，解決長期以來原住民土地主管機關的爭議，也呼應原住民社會的訴求。
原委會表示，「原住民保留地開發管理辦法」在1990年發布，當時原民會尚未成立，由內政部主管，落實原住民自治精神，內政部修正「原住民保留地開發管理辦法」，將條文中之中央主管機關修正為行政院原住民委員會，經行政院在今年4月25號修正發布施行。原委會主委瓦歷斯‧貝林表示，目前原民會仍有許多原住民土地政策、法律等陸續推動中，如研擬「原住民土地及海域法」草案及傳統領域調查等，原民會未來將努力完成後續工作。