同樣是推動汙水下水道建設，政府自辦沒疑義，中央2007年度預計補助12億餘元給北縣，但委託民間建設營運的BOT方式，因不知汙水下水道如何產生投資報酬率吸引民間投資，疑慮未除，預算被立法院凍結，進退都複雜。
北縣府表示，淡水汙水下水道系統是唯一已簽約的BOT案，凍結預算的影響不明顯。板新污水系統雖已與業者完成議約，但簽約主體縣府擔心簽了約，中央卻沒錢補助，萬一要改為自建，進程中連退場機制都困難，所以不敢貿然簽下去。縣府強調，以BOT方式推動，不僅技術、適法性都要嚴謹，財務計畫也必須完善，否則一簽35（施工、營運）年，反悔都來不及。