環保署宣布，自2007年1月起，生垃圾不得進掩埋場，都要先焚化，燒成灰渣，再送進垃圾掩埋場。南投縣13鄉鎮市，除草屯鎮有焚化爐，魚池和中寮將專案申請外，其餘10個鄉鎮市的垃圾，2007年起都將外運焚化。
南投市牛運堀垃圾場已經飽和，目前垃圾外運到竹山鎮垃圾場掩埋。南投市牛運堀垃圾場目前正在擴建，承包商把陳年的垃圾，從地底挖出來，載到外地焚化。7個月後，垃圾場擴建完工，外鄉鎮焚化爐的灰渣，也可以送到牛運堀垃圾場掩埋。
有清潔隊員說，環保署的政策反覆不定，幾年前要興建區域焚化爐，因此才有在集集鎮興建焚化爐的計畫。但是因為居民反對，集集焚化爐沒蓋成。之後環保署又全面停止興建焚化爐，並且改以補助經費，將垃圾外運。現在又規定生垃圾不准進場焚化，真不知環保署垃圾處理的下一步，會是那種型態。