鄰近二仁溪主支流三爺宮溪的仁德、仁義等村近年屢屢水患，村民質疑是因近年配合中山高拓寬工程修建排水系統排水功能不良，且涵洞太窄只容一輛車通過，使得原本能很快從中山高東側流向西側進入三爺宮溪的積水難以消退，致中山高東側人口密集社區一再淹水。營建署等單位8月21日會勘時認為，下游三爺宮溪氾濫是水患主因，但承諾優先拓寬排水渠、疏濬地下排水道，若仍淹水，將檢討是否拉大涵洞斷面。
各單位承諾土庫仔排水渠整治會配合水利局整治計畫進行，若土庫仔排水下游拓寬為4公尺後繼續淹水，營建署將檢討都市計畫排水系統，改善高速公路箱涵斷面不足問題。