國際農業生物科技產業應用中心（ISAAA）2014年最新報告指出，巴西是僅次於美國、全球栽培基改作物第2多的國家，同時也是農藥使用大國。
ISAAA報告指出，2013年巴西共栽種4030萬公頃的基改黃豆、玉米和棉花；美國栽種7020萬公頃。阿根廷排名第3（2440萬公頃），其次是印度（1100萬公頃）、加拿大（1080萬公頃）、中國大陸（420萬公頃）、巴拉圭（360萬公頃）、南非（290萬公頃）、巴基斯坦（280萬公頃）、烏拉圭（150公頃）。
巴西主要栽種的基改作物為黃豆、玉米、棉花及稻米，大片栽種基改作物固然是因其經濟利益考量，但發展生質燃料只占其中一小部分，主要仍為降低生產成本，提高產量與利潤。
巴西綠色和平組織（Greenpeace）認為，大量使用基改作物的農業模式不可持續：巴西因栽種基改作物增加農藥使用量，已經嚴重威脅土地、農業生物多樣性及農產品質量安全。